MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leuconostoc sp. C2 chromosome

Total Repeats: 36111

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015734	TTC	2	6	295	300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339490183
2	NC_015734	AAAGC	2	10	323	332	60 %	0 %	20 %	20 %	339490183
3	NC_015734	ATA	2	6	348	353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339490183
4	NC_015734	TAAA	2	8	375	382	75 %	25 %	0 %	0 %	339490183
5	NC_015734	GAA	2	6	398	403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339490183
6	NC_015734	AGA	2	6	439	444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339490183
7	NC_015734	ATT	2	6	544	549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339490183
8	NC_015734	ATT	2	6	560	565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339490183
9	NC_015734	ACG	2	6	574	579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339490183
10	NC_015734	ATG	3	9	597	605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339490183
11	NC_015734	TCG	2	6	610	615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339490183
12	NC_015734	T	6	6	616	621	0 %	100 %	0 %	0 %	339490183
13	NC_015734	A	6	6	625	630	100 %	0 %	0 %	0 %	339490183
14	NC_015734	GTC	2	6	698	703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339490183
15	NC_015734	ATGGAA	2	12	776	787	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	339490184
16	NC_015734	AAT	2	6	824	829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339490184
17	NC_015734	T	6	6	892	897	0 %	100 %	0 %	0 %	339490184
18	NC_015734	GAT	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339490184
19	NC_015734	GAT	2	6	1010	1015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339490184
20	NC_015734	TAA	2	6	1039	1044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339490184
21	NC_015734	GAT	2	6	1070	1075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339490184
22	NC_015734	TGA	2	6	1081	1086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339490184
23	NC_015734	TGA	2	6	1093	1098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339490184
24	NC_015734	AG	3	6	1115	1120	50 %	0 %	50 %	0 %	339490184
25	NC_015734	ATTTCA	2	12	1241	1252	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	339490184
26	NC_015734	TTA	2	6	1257	1262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339490184
27	NC_015734	ATT	2	6	1274	1279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339490184
28	NC_015734	ATA	2	6	1347	1352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339490184
29	NC_015734	GTT	2	6	1436	1441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339490184
30	NC_015734	TAA	2	6	1444	1449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339490184
31	NC_015734	A	6	6	1461	1466	100 %	0 %	0 %	0 %	339490184
32	NC_015734	A	6	6	1482	1487	100 %	0 %	0 %	0 %	339490184
33	NC_015734	GTAA	2	8	1542	1549	50 %	25 %	25 %	0 %	339490185
34	NC_015734	TTA	2	6	1568	1573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339490185
35	NC_015734	TGC	2	6	1581	1586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339490185
36	NC_015734	TAG	2	6	1595	1600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339490185
37	NC_015734	GGT	2	6	1642	1647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339490185
38	NC_015734	GAA	2	6	1663	1668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339490185
39	NC_015734	TGA	2	6	1671	1676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339490185
40	NC_015734	ATT	2	6	1702	1707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339490185
41	NC_015734	TAT	2	6	1743	1748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339490185
42	NC_015734	T	7	7	1817	1823	0 %	100 %	0 %	0 %	339490185
43	NC_015734	ATG	2	6	1826	1831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339490185
44	NC_015734	TATT	2	8	1898	1905	25 %	75 %	0 %	0 %	339490185
45	NC_015734	A	6	6	1937	1942	100 %	0 %	0 %	0 %	339490185
46	NC_015734	ATTA	2	8	2126	2133	50 %	50 %	0 %	0 %	339490186
47	NC_015734	A	6	6	2182	2187	100 %	0 %	0 %	0 %	339490186
48	NC_015734	ATG	2	6	2298	2303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339490186
49	NC_015734	GTT	2	6	2309	2314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339490186
50	NC_015734	GGT	3	9	2327	2335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339490186
51	NC_015734	AT	3	6	2358	2363	50 %	50 %	0 %	0 %	339490186
52	NC_015734	T	6	6	2372	2377	0 %	100 %	0 %	0 %	339490186
53	NC_015734	AGT	2	6	2390	2395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339490186
54	NC_015734	AGTC	2	8	2445	2452	25 %	25 %	25 %	25 %	339490186
55	NC_015734	AT	3	6	2466	2471	50 %	50 %	0 %	0 %	339490186
56	NC_015734	A	7	7	2501	2507	100 %	0 %	0 %	0 %	339490186
57	NC_015734	TGG	2	6	2533	2538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339490186
58	NC_015734	CAT	2	6	2549	2554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339490186
59	NC_015734	TGA	2	6	2611	2616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339490186
60	NC_015734	GCT	2	6	2633	2638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339490186
61	NC_015734	ATT	2	6	2724	2729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339490186
62	NC_015734	A	7	7	2775	2781	100 %	0 %	0 %	0 %	339490186
63	NC_015734	TAA	2	6	2857	2862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339490186
64	NC_015734	TGG	2	6	2878	2883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339490186
65	NC_015734	T	6	6	2947	2952	0 %	100 %	0 %	0 %	339490186
66	NC_015734	AGA	2	6	3031	3036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339490186
67	NC_015734	CTT	2	6	3091	3096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339490186
68	NC_015734	GTAA	2	8	3110	3117	50 %	25 %	25 %	0 %	339490186
69	NC_015734	AAC	2	6	3131	3136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339490187
70	NC_015734	ATC	2	6	3163	3168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339490187
71	NC_015734	ACA	2	6	3214	3219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339490187
72	NC_015734	AGC	2	6	3254	3259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339490187
73	NC_015734	GAT	3	9	3267	3275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339490187
74	NC_015734	CAT	2	6	3284	3289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339490187
75	NC_015734	TTA	2	6	3300	3305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339490187
76	NC_015734	ATG	3	9	3418	3426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339490187
77	NC_015734	TTG	2	6	3463	3468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339490187
78	NC_015734	CAC	2	6	3533	3538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339490187
79	NC_015734	ATT	2	6	3579	3584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339490187
80	NC_015734	AGC	2	6	3602	3607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339490187
81	NC_015734	A	6	6	3627	3632	100 %	0 %	0 %	0 %	339490187
82	NC_015734	TGG	2	6	3671	3676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339490187
83	NC_015734	AAC	2	6	3753	3758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339490187
84	NC_015734	CGC	2	6	3775	3780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339490187
85	NC_015734	CAG	2	6	3793	3798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339490187
86	NC_015734	CAG	2	6	3826	3831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339490187
87	NC_015734	GTT	2	6	3846	3851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339490187
88	NC_015734	TGA	2	6	3977	3982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339490187
89	NC_015734	TGG	2	6	4020	4025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339490187
90	NC_015734	AAG	2	6	4090	4095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339490187
91	NC_015734	TGA	2	6	4127	4132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339490187
92	NC_015734	A	6	6	4165	4170	100 %	0 %	0 %	0 %	339490187
93	NC_015734	GAT	2	6	4318	4323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339490188
94	NC_015734	ATT	2	6	4330	4335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339490188
95	NC_015734	GGT	2	6	4360	4365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339490188
96	NC_015734	TGA	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339490188
97	NC_015734	TGG	2	6	4446	4451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339490188
98	NC_015734	T	6	6	4504	4509	0 %	100 %	0 %	0 %	339490188
99	NC_015734	CCGCTT	2	12	4560	4571	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	339490188
100	NC_015734	GTGC	2	8	4600	4607	0 %	25 %	50 %	25 %	339490188
101	NC_015734	TGG	3	9	4614	4622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339490188
102	NC_015734	ATGC	2	8	4639	4646	25 %	25 %	25 %	25 %	339490188
103	NC_015734	ATG	2	6	4663	4668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339490188
104	NC_015734	GCG	2	6	4843	4848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339490188
105	NC_015734	TAT	2	6	4875	4880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339490188
106	NC_015734	TGG	3	9	4887	4895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339490188
107	NC_015734	GGC	2	6	4914	4919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339490188
108	NC_015734	A	7	7	4931	4937	100 %	0 %	0 %	0 %	339490188
109	NC_015734	CTG	2	6	4946	4951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339490188
110	NC_015734	GTT	2	6	5032	5037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339490188
111	NC_015734	AAG	2	6	5039	5044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339490188
112	NC_015734	TGA	2	6	5075	5080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339490188
113	NC_015734	TGC	2	6	5133	5138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339490188
114	NC_015734	GAT	2	6	5181	5186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339490188
115	NC_015734	GAT	2	6	5194	5199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339490188
116	NC_015734	GTT	2	6	5221	5226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339490188
117	NC_015734	CAT	2	6	5289	5294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339490189
118	NC_015734	TGT	2	6	5314	5319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339490189
119	NC_015734	GAT	2	6	5327	5332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339490189
120	NC_015734	TGT	2	6	5500	5505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339490189
121	NC_015734	ACA	2	6	5510	5515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339490189
122	NC_015734	CTT	2	6	5520	5525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339490189
123	NC_015734	AAC	2	6	5647	5652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339490189
124	NC_015734	TAA	2	6	5707	5712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339490189
125	NC_015734	GCAAC	2	10	5756	5765	40 %	0 %	20 %	40 %	339490189
126	NC_015734	TCG	2	6	5842	5847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339490189
127	NC_015734	AGT	2	6	5942	5947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339490189
128	NC_015734	AGGCAC	2	12	5952	5963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339490189
129	NC_015734	GCA	2	6	6014	6019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339490189
130	NC_015734	ATT	2	6	6074	6079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339490189
131	NC_015734	TTA	2	6	6141	6146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339490189
132	NC_015734	TGCA	2	8	6147	6154	25 %	25 %	25 %	25 %	339490189
133	NC_015734	TTG	2	6	6189	6194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339490189
134	NC_015734	CAA	2	6	6233	6238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339490189
135	NC_015734	GTA	2	6	6246	6251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339490189
136	NC_015734	ATT	2	6	6302	6307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339490189
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138	NC_015734	ATC	2	6	6420	6425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339490189
139	NC_015734	TGAT	2	8	6429	6436	25 %	50 %	25 %	0 %	339490189
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143	NC_015734	ATC	2	6	6557	6562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339490190
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150	NC_015734	CAT	2	6	6704	6709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339490190
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244	NC_015734	AGA	2	6	11721	11726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339490195
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250	NC_015734	TATGGT	2	12	12053	12064	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	339490196
251	NC_015734	AAT	2	6	12102	12107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339490196
252	NC_015734	TTG	2	6	12331	12336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339490197
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254	NC_015734	ACGA	2	8	12448	12455	50 %	0 %	25 %	25 %	339490197
255	NC_015734	ATC	2	6	12508	12513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339490197
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257	NC_015734	GCA	2	6	12596	12601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339490197
258	NC_015734	ATTT	2	8	12621	12628	25 %	75 %	0 %	0 %	339490197
259	NC_015734	T	6	6	12626	12631	0 %	100 %	0 %	0 %	339490197
260	NC_015734	GC	3	6	12648	12653	0 %	0 %	50 %	50 %	339490197
261	NC_015734	TAA	2	6	12657	12662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339490197
262	NC_015734	TTTG	2	8	12737	12744	0 %	75 %	25 %	0 %	339490197
263	NC_015734	GT	4	8	12762	12769	0 %	50 %	50 %	0 %	339490197
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265	NC_015734	TAA	2	6	12868	12873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339490197
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